Como resultado de su compleja historia, en el Sudeste Asiático se ha rendido culto a una larga lista de deidades y espíritus. Entre los de la naturaleza, Sri, la diosa del arroz, es muy venerada, y el dios o espíritu de la montaña o volcán también es temido, sobre todo en las islas, como lo es el dios del mar.
En la fase hinduista se dedicaron muchos templos a Shiva y Vishnu. En Bali, hinduista, aún persisten estos dioses y otros muchos, cuyas características se han fundido con las de las antiguas deidades indígenas. En el norte se venera a Buda y en las historias budistas aparecen también deidades hindúes, como Indra, Sri Devi y Brahma.